Journée satellite JOBIM 2008
Modélisation dynamique et simulation des réseaux biologiques
JOBIM 2008 satellite meeting : Dynamical modelling and simulation of biological networks
3 juillet 2008 - Lille, Campus de Villeneuve-d'ascq, Amphi 14, rez-de-chaussee batiment SUP
Attention, les journées satellites ne sont pas organisées sur le même site que JOBIM.
Dans le cadre des Journées Ouvertes Biologie, Informatique et
Mathématiques (JOBIM 2008) et dans la foulée des rencontres
organisées depuis 2003, nous proposons
une nouvelle réunion satellite sur la modélisation dynamique et la simulation des
réseaux biologiques.
Cette rencontre est organisée avec le soutien du GDR Bio-Informatique et de la Région Pays de la Loire via le projet BIL (Bio-Informatique Ligérienne).
Nous lançons un appel à
communication aux jeunes doctorants ou
post-doctorants. Dans une démarche d'animer la
communauté de la thématique, nous souhaitons
réunir les jeunes doctorants ou post-doctorants, leur permettre de
présenter leurs travaux et dialoguer avec un panel de chercheurs du
domaine.
Programme de la journée
| 9h30 - 10h30 |
Alexander Bockmayr (Berlin), Temporal constraints in the
logical analysis of regulatory networks (slides) |
| 10h30 - 11h00 | Pause |
| 11h00 - 12h00 | Caroline Lemerle (EMBL Heidelberg), Rewiring transcription networks and
dissecting growth patterns |
| 12h00 - 12h20 | Carito Guziolowski (IRISA, Rennes), Adding missing
post-transcriptional regulations to a regulatory network (slides) |
| 12h20 - 12h40 | Sylvain Blachon (Irisa, Rennes), Exploration of array
CGH and expression data on Ewing tumors (slides) |
| 13h00 - 14h10 | Repas |
|
14h10 - 14h30 | Omar Gaci (LITIS, Le Havre), Characterization of amino
acid interaction networks in proteins (slides) |
|
14h30 - 14h50 | Etienne Farcot (CPT, Marseille), Un modèle markovien
des réarrangements V(D)J de gènes TCR (slides)
|
|
14h50 - 15h10 | Mbodj Abibatou (TAGC, Marseille), Logical modelling of
Drosophila mesoderm differentiation (slides)
|
|
15h10 - 15h30 | Zohra Khalis (I3S, Nice), Biological regulatory
networks with multiplexes
|
|
15h30 - 15h50 | Aurélien Risk (Projet contraintes, Inria Rocquencourt)
On a Continuous Degree of Satisfaction of Temporal Logic Formulae
with Applications to Systems Biology (slides)
|
|
15h50 - 16h20 | Pause |
|
16h20 - 16h40 | Axel Cournac (INLN, Nice), Réseaux biologiques soumis à
une stimulation périodique
|
|
16h40 - 17h00 | Mahsa Behzadi (LIX, Palaiseau), Cellular Metabolism
Simulation with the integration of the external environment
|
|
17h00 - 17h20 | Gwenael Kervizic (Inserm U613, Brest), Dynamical
modeling in physiopathology
|
Participation
La participation est gratuite et ouverte à tous, mais une
pré-inscription est nécessaire AVANT le 14 juin. Si vous souhaitez participer,
merci de remplir le formulaire suivant (les champs * sont obligatoires) :
Organisation
- Grégory Batt,, INRIA, Rocquencourt.
- Jérémie Bourdon, LINA, Nantes.
- Damien Eveillard, LINA, Nantes.
- Adrien Richard, I3S, Nice.
- Anne Siegel, IRISA, Rennes.
Liste des participants inscrits
- , ,
- Batt Grégory, INRIA, Domaine de Voluceau Rocquencourt BP 105, 78153 Le Chesnay Cedex, France
- Behzadi Mahsa, laboratoire d'informatique de l'Ecole Polytechnique, LIX, Ecole Polytechnique, 91128 Palaiseau Cedex France
- Berthoumieux Sara, IBIS de l'INRIA Grenoble Rhône-Alpes, 655 avenue de l'Europe 38330 Montbonnot
- Bessadok Anis, Atelier de Bioinformatique de Paris VI,
- Blachon Sylvain, IRISA, Rennes,
- Blavy Pierre, INRA, UMR1079 INRA / Agrocampus de Rennes, SENHA Domaine de la Prise, 35590 Saint-Gilles, France
- Bordron Philippe, Lina, LINA, Université de Nantes, 2, rue de la Houssinière 44322 Nantes Cedex 03 - France
- Bourdon Jérémie, LINA, CNRS UMR 6241, Université de Nantes, 2, rue de la Houssinière 44322 Nantes Cedex 03 - France
- Brinza Lilia, BF2I, UMR 203 INRA INSA-Lyon BF2I, IFR 41 Biologie Fonctionnelle Insectes et interactions Bat. L.-Pasteur, 20 ave. A. Einstein F 69621 Villeurbanne Cedex, France, Europe
- Carat Solenne, institut du thorax INSERM U915, faculté de Médecine 1 rue gaston veil 44035 Nantes
- Comet Jean-paul, I3S, Nice
- Cournac Axel, INLN, Nice,
- Dumas Estelle, ibis, 655 Avenue de l'Europe 38334 Saint Ismier CEDEX, France
- Eveillard Damien, LINA - Univerité de Nantes, CNRS UMR 6241, Université de Nantes, 2 rue de la Houssinière 44322 Nantes Cedex 03 - France
- Farcot Etienne, CPT, Centre de Physique Théorique CNRS Luminy Case 907 13288 Marseille CEDEX 09 - France
- Fauré Adrien, TAGC - INSERM U928, INSERM U928 TAGC Campus Scientifique de Luminy Case 928 13288 Marseille Cedex 09 FRANCE
- Fertin Guillaume, LINA, Université de Nantes, 2 rue de la Houssinière BP 92208 44322 Nantes Cedex 3
- Fromentin Jonathan, IRCCyN, IRCCyN - 1, rue de la Noë - BP 92 101 - 44321 Nantes CEDEX 03
- Gaci Omar, LITIS, Université du Havre - UFR Sciences et Techniques 25, rue Philippe Lebon 76058 Le Havre Cedex
- Gaugain Claire, LMGM - CNRS Université Paul Sabatier Toulouse III, Batiment IBCG Université Paul Sabatier Toulouse III 118 route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex
- Guziolowski Carito, IRISA, Rennes,
- Jwbshmrup Jwbshmrup, yDORtStXxntp, odkTE4 umrqwgepmakp, [url=http://tyedusbjsupz.com/]tyedusbjsupz[/url], [link=http://ddjsskondtqq.com/]ddjsskondtqq[/link], http://spioldipyhtl.com/
- Kervizic Gwenael, Inserm U613, Faculté de Médecine 22, Avenue Camille Desmoulins 29238 Brest Cedex 3 FRANCE
- Khalis Zohra, I3S, Nice,
- Kwasigroch Jean marc, Unité de bioinformatique géomique et structurale, Université Libre de Bruxelles Av F.D. Roosevelt, 50 1050 Bruxelles, Belgium
- Legaie Roxane, INSERM U915, Institut du thorax, Inserm UMR 915 - Plateforme Transcriptome Faculté de Médecine 1, rue Gaston Veil 44035 Nantes, France Phone : 33 2 40 41 29 86 Fax : 33 2 40 41 29 50
- Lhoussaine Cedric, LIFL (Universite Lille 1),
- Mbodj Abibatou, TAGC, TAGC ERM206 case 928 163, Avenue de Luminy 13288 MARSEILLE cedex 09
- Monteiro Pedro tiago, IBIS, 655 Avenue de l'Europe, 38334 Saint Ismier CEDEX, France
- Naldi Aurélien, TAGC (INSERM U928), 163 avenue de luminy 13009 Marseille
- Nebut Mirabelle, LIFL (Université de Lille1),
- Nguyen Hoai-tuong, LINA, CNRS UMR 6241, Université de Nantes, 2, rue de la Houssinière 44322 Nantes Cedex 03 - France
- Niehren Joachim, INRIA Lille,
- Ouattara Djomangan adama, Université Libre de Bruxelles (Unité de Biologie Théorique et Computationnelle), Service de Chimie Physique et Biologie Théorique U.L.B., Campus Plaine, CP 231, B-1050 Bruxelles, Belgique
- Paimparay Germain, Master Bioinfo Rouen/Genfit, LILLE, 17 rue littré 59000 LILLE
- Pecou Elisabeth, J.-A. Dieudonné, UMR CNRS 6621, Université de Nice-Sophia Antipolis Parc Valrose 06104 Nice
- Raharijaona Mahatsangy, institut du thorax INSERM U915, Institut du thorax, INSERM U915 Faculté de Médecine, 1 rue Gaston Veil 44035 Nantes cedex 1, France
- Richard Adrien, I3S, Nice
- Rizk Aurélien, INRIA Paris-Rocquencourt, Domaine de Voluceau Rocquencourt BP 105 78153 Le Chesnay Cedex
- Siegel Anne, IRISA, Rennes,
- Texier Frederic, Stage à Genoscreen et etudian faculté des sciences de nantes, 15 rue adolphe casse 59000 lille
- Thieffry Denis, INRIA Paris-Rocquencourt, Domaine de Voluceau Rocquencourt BP 105 78153 Le Chesnay Cedex
Informations pratiques
La journée se déroule à Lille, sur le campus de l'université de Lille 1, Campus de Villeneuve-d'ascq, Amphi 14, rez-de-chaussee batiment SUP
Attention, les journées satellites ne sont pas organisées sur le même site que JOBIM.
Soutiens
Cette journée reçoit le soutien du GDR Bio-informatique et des Pays de la Loire via le projet BIL (Bio-Informatique Ligérienne).